Ya encontrè la solución, en oml_extensions_precall.conf en el contexto sub-oml-pre-agent-queue-chan agregue:
same => n,Set(PJSIP_HEADER(add,Omlcrmnombre)=${Omlcrmnombre})
same => n,Set(PJSIP_HEADER(add,Omlcrmciudad)=${Omlcrmciudad})
same => n,Set(PJSIP_HEADER(add,Omlcrmestado)=${Omlcrmestado})
Con esto se pasan las variables correctamente, tocarà hacerlo en un custom, ya que supongo en este contexto se puede sobreescribir